Геологический музей имени Вернадского – первый естественнонаучный музей в Москве – ведет свою историю от Минерального кабинета Императорского Московского университета. Основу кабинета составил дар династии Демидовых: уральский заводчик Акинфий Демидов выкупил коллекцию из 6000 минералов в начале 1740-х гг. в Саксонии у известного химика и минералога Генкеля. В 1791 г. Музей натуральной истории переместили в новое здание Московского университета на Моховой улице. В начале XIX в. Минеральный кабинет (музей) обладал одной из лучших в Европе минералогических коллекций. К сожалению, в пожаре Москвы во время Отечественной войны 1812 г. погибла большая часть музейных ценностей.
Здание, в котором сейчас располагается музей, было построено около ста лет назад. Руководить строительством здания пригласили академика архитектуры Романа Ивановича Клейна (1858-1924), хорошо известного московского зодчего. Клейн стал автором детальных чертежей нового рабочего проекта и архитектором-строителем здания. Строительство особняка пришлось на трудный период нашей истории: первая мировая война, Февральская и Октябрьская революции. Кредиты на строительство то сокращались, то закрывались вовсе. Тем не менее, к 1918 году строительство дома на Моховой было благополучно завершено.Геологический музей в здании особняка был открыт для публики в 1922 г.
